Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms