Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Nus1Q99LJ8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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