Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms