Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmp1Q99KU0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms