Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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