Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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