Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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