Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms