Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SelenomQ8VHC3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms