Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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