Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Vmn1r200Q8R281 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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