Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms