Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc12Q8K2L8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms