Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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