Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms