Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms