Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms