Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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