Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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