Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo48Q8CAT8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo48Q8CAT8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo48Q8CAT8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo48Q8CAT8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo48Q8CAT8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms