Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms