Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nek11Q8C0Q4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Nek11Q8C0Q4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Nek11Q8C0Q4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Nek11Q8C0Q4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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