Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 D330050G23Rik-202ENSMUST00000128305 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Hip1-210ENSMUST00000212301 1625 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms