Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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