Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc2Q8BKV1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.3 ms