Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trim6Q8BGE7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trim6Q8BGE7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trim6Q8BGE7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim6Q8BGE7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms