Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms