Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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