Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Shq1Q7TMX5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Shq1Q7TMX5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Shq1Q7TMX5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Shq1Q7TMX5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Shq1Q7TMX5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Shq1Q7TMX5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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