Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl2Q78Y63 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms