Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms