Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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