Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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