Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6DFW0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms