Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms