Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg9aQ68FE2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg9aQ68FE2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg9aQ68FE2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms