Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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