Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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