Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Usf1Q61069 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Usf1Q61069 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Usf1Q61069 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Usf1Q61069 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Usf1Q61069 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms