Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HellsQ60848 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HellsQ60848 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HellsQ60848 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms