Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf123Q5XPI3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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