Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim38Q5SZ99 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trim38Q5SZ99 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trim38Q5SZ99 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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