Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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