Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms