Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms