Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2cd3Q52KB6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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