Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Fam220aQ3ZN08 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam220aQ3ZN08 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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