Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms