Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms