Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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